-Dans la grande Pégase, nommée Andromeda VI, douze Colonies d'une civilisation humaine ancienne, se firent sur douze planètes d'une géante gazeuse nommée « Zeus ». Cette civilisation est très avancer et nul ne sais comment ils sont arriver dans cette partie de la Galaxie, les douze planètes font une civilisation avec un système politique et une avancer technologique considérable. Tous suivaient une politique de survie entre elles, une station spatial de l'armée créer pour défendre les planètes. Chaque planètes dans se système étaient différentes, Caprica, la capital de l'alliance colonial était en on centre et la première planète colonisée au début .

Plus tard, quand leur technologies furent plus avancer, les Kobol, nom donner a cette civilisation, créèrent une race robotique nommée « Centurion » afin de les aider dans leur quotidiens, cette race évolua bien plus vite que se qu'ils croyaient et disparurent des années plus tard sans laisser de trace. Une légende disais qu'il existerais une treizième planète quelques part dans l'univers, cette planète ou colonie se nommais « Terre », cependant, cette légende ne serais révélée qu'en temps utile et seulement si il arrivais quelque chose aux colonies.


-Dans la voie Lactée, planète Terre, la SGC (Stargate Command), eu vent de la découverte d'une cité dans la Galaxie de Pégase, cette cité avait été construite il y a des années par les anciens, race connue pour avoir une technologie bien plus développée que les autres. Cette cité nommée
« Atlantis », se vois envoyer un groupe de chercheur et militaire diriger par le Docteur Weir, mais c'est sens compter sur la menace des Wraith et des Asurans (Replicateurs) qui leur mettent des bâtons dans les roues.
Malgré la défaite d'Anubis, les goa'ulds continuent de ravager la galaxie avec leurs guerres et l'esclavage de milions de gens. La Terre aidée par les rebelles jaffas et les asgards mènent une lutte contre les grands maitres goa'ulds. Même si les asgards sont très affaibli depuis la destruction des derniers réplicateurs, ils continuent d'essayer de faire respecter le traité entre les goa'ulds et leur peuple sur les planètes protégées.


Dans la Galaxie :


-Andromeda VI, les centurions disparut des colonies ont construits une flotte immense pour attaquer leur créateurs, ils ont énormément évoluer et ressemble maintenant a des cyborgs. Ils s'appellent désormais « Cylons » et sont créer en masse en douze catégories, reconnu entre eux par des numéros. Ressemblant en tout points a des humains, ils sont envoyer a travers les Galaxies pour se fondre dans les diverses civilisations.[/spoiler]